A protozoonok egysejtű organizmusok, amelyek képesek betegségeket okozni a hörcsögökben, amelyek közül a leggyakoribb a protozoa gasztroenteritis. Noha az egészséges hörcsögök emésztőrendszerükben gyakran hordoznak protozoonokat káros mellékhatások nélkül, a fiatal vagy stresszes hörcsögöknél az immunrendszer gyengülése következtében bélfertőzés és hasmenés alakulhat ki
A proliferatív enteritis olyan betegség, amely a vékonybél gyulladását és az azt követő hasmenést okozza. Gyakrabban a károsodott immunrendszerű hörcsögökben található, a Lawsonia intracellularis baktérium fertőzésének köszönhető. Megállapították, hogy a stressz, a túlzsúfolt állapotok és az étrend változása veszélyezteti a hörcsög immunrendszerét, különösen a fiatal hörcsögökben, amelyet a proliferatív bélgyulladás gyorsan elpusztíthat
A policisztás betegség folyadékkal töltött zsákokat, úgynevezett cisztákat eredményez, amelyek a hörcsög belső szerveiben fejlődnek ki. A hörcsögön egy vagy több ciszta alakulhat ki - általában a májában -, amelyek mindegyike 3 centiméter átmérőjű. Egyéb belső szervek, amelyek kialakíthatják ezeket a cisztákat, a hasnyálmirigy, a mellékvese, a kiegészítő nemi mirigyek (férfiaknál) és / vagy a petefészkek vagy a méhét borító szövetek (nőknél)
A törések, közismertebb nevén törött csontok, valójában meglehetősen gyakoriak a hörcsögöknél. Ezek főleg olyan balesetek miatt következnek be, mint az állat nem megfelelő kezelése, vagy amikor egy hörcsög megpróbálja kiszabadítani a lábát a ketrec dróthálójából vagy a kerekéből. Mivel a hörcsögök nagyon kicsiek, a törött csontokat nehéz kezelni. A hörcsögök töréseinek gyógyítása azonban meglehetősen egyszerű, de a hörcsögöt megfelelően kell megfékezni és megfelelő pihenést biztosítani a teljes gyógyulás érdekében
A tüdőgyulladással vagy a tüdő gyulladásával általában nem találkozunk hörcsögöknél. Amikor mégis bekövetkezik, általában egy vagy többféle baktérium fertőzésének eredménye, néha vírusokkal vagy más típusú fertőző ágensekkel együtt. Ezeket a fertőzéseket a hörcsög különösen nehezen tudja leküzdeni, ha stresszt kiváltó környezeti változások vannak, például hirtelen szobahőmérséklet-változás
A nephritis olyan vesebetegség, amely vese gyulladást okoz. Ez előfordulhat az egyik vagy mindkét vesében. A gyulladást általában vírusos vagy bakteriális fertőzés okozza. A vesegyulladás oka lehet az immunrendszer rendellenessége vagy a magas vérnyomás is. Kezelés nélkül bekövetkezik a vesék degenerációja, ahol a normális veseszövetet rostos szövet helyettesíti. Ezt nevezzük nephrosisnak
A székrekedés és a hasmenés a széklet konzisztenciájának, összetételének és az átjutás gyakoriságának leggyakoribb rendellenessége. A hörcsögök számos okból székrekedhetnek: bélparaziták, például galandférgek, bélelzáródás vagy a belek összecsukása (intussusception)
A pangásos szívelégtelenség olyan állapot, amelyben a szívizmok gyengülnek, és nem képesek hatékonyan pumpálni a vért az egész testben. Ennek következtében a vér összegyűlik a vénákban és az azt követő ödéma
Az Escherichia coli baktériumok által okozott hasmenés nagyon gyakori jelenség a hörcsögöknél, különösen a fiatal és újszülött hörcsögöknél, akiknek immunrendszere gyengén fejlett. Jellemzően az E. coli fertőzés (vagy Colibacillosis) az egészségtelen életkörülmények miatt következik be, és szennyezett étel és víz lenyelésével terjed, bár a levegőn keresztül is terjedhet
A hörcsögök többféle endoparazita féregfertőzésben szenvedhetnek. Az egyik ilyen belső parazita a pinworm. Hörcsögökben ritkán fordul elő, de komplikációkat okoz az állat emésztőrendszerében. Más fertőzött hörcsög ürülékében található, jellemzően szennyezett takarmánnyal és vízzel terjed